Juurikanavat puhdistetaan ja laajennetaan tavallisesti ensimmäisellä käyntikerralla ja hampaaseen laitetaan desinfioiva lääke, jonka jälkeen ontelo suojataan tiiviisti väliaikaisella paikalla.

Hammasjuuren tulehduksen luonteesta riippuen juurihoito saattaa vaatia yhdestä viiteen käyntikertaa. Kun ollaan varmoja, että bakteerit on saatu poistettua, kanavat täytetään kumimaisesta materiaalista valmistetuilla nastoilla, jotta estettäisiin bakteerien pääsy takaisin kanavajärjestelmään. Juurikanavien täyttämisen jälkeen tehdään hammaskruunu.

Jos hammas on elävä, juurihoito tehdään puudutuksessa. Puudutusta ei tarvita, jos hammas on kuollut.Lyhytaikaista kipua saattaa esiintyä, kun juurikanavan preparoinnin yhteydessä työnnetään materiaalia juuren pään yli.

Onnistuneen juurihoidon paranemisennuste on hyvä. Puolen vuoden kuluttua juurihoidon jälkeen otetaan röntgenkuva juurenpään alueen